彼藥師琉璃光如來得菩提時。由本願力觀諸有情。遇眾病苦瘦瘧乾消黃熱等病。或被厭魅蠱道所中。或復短命或時橫死。欲令是等病苦消除。所求願滿。時彼世尊入三摩地。名曰：「滅除一切眾生苦惱」。既入定已。於肉髻中出大光明。光中演說大陀羅尼……

爾時光中說此咒已。大地震動。放大光明。一切眾生病苦皆除。受安隱樂。曼殊室利。若見男子女人有病苦者。應當一心為彼病人清淨澡漱或食或藥或無蟲水。咒一百八遍與彼服食。所有病苦悉皆消滅。若有所求指心念誦。皆得如意無病延年。命終之後生彼(藥師琉璃)世界。得不退轉。乃至菩提。是故曼殊室利。若有男子女人。於彼藥師琉璃光如來。至心慇重恭敬供養者。常持此咒。勿令廢忘！

若有受持此真言，能拔身中過去生死一切重罪。不復經歷三途。免離九橫超越眾苦。
十方世界隨處安樂。自在無礙法應如是。